科隆大学的专业设置非常广泛，涵盖了文、理、工、法等多个学科领域。以下是一些主要的专业领域及其相关课程：
人文学科
传播学、艺术史、英语、西班牙语、法语、葡萄牙语、音乐、艺术、艺术教育、亚洲研究、跨学科研究、戏剧、视觉艺术、传媒艺术、人文研究、新闻学、统计学、化学、地理学、数学、物理、心理学、生物、地球科学、海洋生物学、体育、艺术教育、特殊教育、幼儿教育、小学教育等。
社会科学
经济学、法学、商业计算、历史、工商管理、德语语言与文学、媒体科学、牙医学、生物学、化学、英美研究、地理、地球科学、人类医学、数学、物理、心理学、浪漫语研究、政治学、健康经济学、国际管理、经济管理等。
自然科学
物理学、数学、化学、地质学、心理学、生物学、地球科学、海洋生物学、自然科学、汉学、语言科学、社会学、社会科学、政治、政治科学、民族学、东南亚区域研究（中国）、气象学、矿物学等。
工程和计算机科学
尽管科隆大学以文理科为主，但它也提供一些工程学科，如环境工程、生物医学、城市建设、信息工程、材料工程、机械工程、化学工程等。
医学
医学院提供医学、牙医学等专业，并在这些领域具有很高的声誉。
神学
提供天主教神学和基督教神学专业。
新增专业
自2024/25冬季学期起，哲学院新增了两个硕士专业：Medienästhetik der deutschen Literatur（德国语言文学的媒体美学）。
其他专业
特殊教育学、斯堪的那维亚哲学、古代近代史、纺织品设计、戏剧—电影—电视科学、神学（天主教）、神学（基督教）、企业经济、国民经济、经济科学、经济教育学、经济学、医学、牙医学、法律、法律（德？法）、生物、物理、数学、化学、地理、地质、心理学、艺术、艺术史、教育学、德语、德国文学、德国哲学、考古学、传统文学、中世纪哲学、希腊哲学、荷兰语、荷兰哲学、东方语系哲学、伊斯兰哲学、英语、英国哲学、法语、历史、哲学、日本语、拉丁哲学、传统哲学、气象学、矿物学等。
科隆大学的优势专业包括经济学、法学、管理学、社会学、历史学和自然科学等。特别是经济学和法学，在德国乃至世界范围内都享有极高的声誉。建议学生在选择专业时，可以根据自己的兴趣和职业规划，重点关注这些优势专业。