长崎大学的专业设置如下：
学部
教育学部
经济学部
医学部
齿学部
药学部
工学部
环境科学部
水产学部
医疗技术短期大学部
研究生院
教育学研究科：教职实践专业（专业学位课程，教职大学院）、教科实践专业（修士课程）
经济学研究科：博士前期课程、博士后期课程
工学研究科：综合工学专业（博士前期课程）、生产系统工程专业（博士后期课程）、绿色系统创建科学专业（5年一贯博士课程）、水产环境科学综合研究科（博士前期课程）、水产学专业（博士前期课程）、环境保全设计专业（博士前期课程）、环境共生政策学专攻（博士前期课程）、海洋环境资源学专攻（博士后期课程）、海洋场生命科学专业（5年一贯博士课程）
医齿药学综合研究科：修士课程、热带医学专业、保健学专业、生命科学专业药、医疗科学专攻、新兴感染症病情控制学系专业、放射线医学科学专攻、博士后期课程
国际健康开发研究科：修士课程、国际健康开发专业
综合信息学研究科：国际交流学科、信息媒体学科
看护学研究科：看护学专攻、营养科学专攻（硕士课程・博士课程）
其他专业
古建筑修复与文化遗产保护专业
国际咨询与管理专业
食品科学专业
物理科学专业
信息网络专业
建议根据个人兴趣和职业规划，选择适合的专业进行深入学习。