南通大学的专业排名如下：
临床医学：
投档线为578分，推荐指数4.6（194人推荐）。
电气工程及其自动化：
投档线为557分，推荐指数4.6（103人推荐）。
儿科学：
投档线为557分。
机械设计制造及其自动化：
投档线为554分。
生物技术：
投档线为548分。
化学（师范，师范类）：
投档线为547分。
土木工程：
投档线为546分。
交通工程：
投档线为546分。
医学检验技术：
投档线为543分。
教育技术学（师范，师范类）：
投档线为542分。
此外，南通大学近三年在全国的排名稳步上升，2024年软科中国大学排名中位列第159位。王牌专业包括学前教育、生物科学、应用心理学、交通设备与控制工程、行政管理、视觉传达设计等国家级一流本科专业，以及历史学、物理学、电子科学与技术、医学影像学、口腔医学、药学、会计学、翻译、化学、地理信息科学、应用统计学、测控技术与仪器、软件工程、音乐学、工程管理等省级一流本科专业。
需要注意的是，排名可能会随着时间和不同评价机构的标准有所变化，以上信息以最新发布的数据为准。