重庆交通大学的王牌专业包括：
交通运输工程：
在全国第四轮学科评估中，该专业位列B等级，是重庆交通大学的优势学科之一。该专业属于工学门类，交通运输类专业大类，高考招生专业为“交通运输类（含交通运输、交通工程、交通设备与控制工程）”，2024年高考选考科目要求为物理&化学。
水利工程：
在全国第四轮学科评估中，该专业位列B等级，是重庆交通大学的重要学科。
土木工程：
该专业在全国第四轮学科评估中位列B等级，是重庆交通大学的王牌专业之一。该专业涵盖房屋建筑、道路桥梁、隧道工程等多个方向。
港口航道与海岸工程：
该专业是重庆交通大学的王牌专业之一，也是国家级特色专业建设点。
机械设计制造及其自动化：
该专业是重庆交通大学的王牌专业之一，也是卓越工程师教育培养计划学科专业。
计算机科学与技术：
该专业是重庆交通大学的王牌专业之一，也是市级特色专业。
物流管理：
该专业是重庆交通大学的王牌专业之一，也是市级特色专业。
工程管理：
该专业是重庆交通大学的王牌专业之一，也是国家级特色专业和市级特色专业。
工程造价：
该专业是重庆交通大学的王牌专业之一，也是市级特色专业。
建筑学：
该专业是重庆交通大学的王牌专业之一，也是市级特色专业。
这些专业在教学质量和学术研究方面都有较高的水平，建议考生在报考时优先考虑。