熊本大学的专业设置包括本科和研究生专业，具体如下：
本科专业
文学部：
包括文学、历史学、综合人间学、信息情报学等。
法学部：
包括法学等。
教育学部：
包括小学校教员养成、中学校教员养成、特别支援学校教员养成、养护教论养成学等。
医学部：
包括临床医学、医学等。
药学部：
包括药学、生命药科学等。
理学部：
包括理学、物质生命化学、材料工学、机械系统工学等。
工学部：
包括社会环境工学、建筑学、情报电器电子工学、书理工学等。
其他专业：
应用科学、信息与图书馆学、生物资源科学、信息科学、生物学、日语语言文化研究、化学、数学、比较文化研究、护理、地球科学、障碍科学、工程系统、科学教育学、人文社会、工程物理、社会研究、心理学、信息媒体发展研究等。
研究生专业
文学研究科：
包括学校教育、特殊支援教育、教科教育等。
法学研究科：
包括法学、现代社会人类学、文化学、教授系统学等。
教育学研究科：
包括保健教育等。
自然科学研究科：
包括理学、复合新领域科学、信息电气电子工学、物质生命化学、唯物工学、机械系统工学、社会环境工学、建筑学等。
社会文化科学研究科：
包括公共政策学等。
医学教育部：
包括新药开发与生命药科学等。
药学教育部：
包括药学等。
生命科学研究部：
包括综合医药科学部门、尖端生命医疗科学部门、环境社会医学等。
保健学教育部：
包括保健学等。
这些专业涵盖了广泛的学术领域，从人文科学到社会科学，再到自然科学和医学，满足了不同学生的学术兴趣和职业发展需求。建议学生在选择专业时，综合考虑自己的兴趣、职业规划以及未来的发展方向。