2006年中国大学排名如下：
1. 清华大学
2. 北京大学
3. 浙江大学
4. 复旦大学
5. 南京大学
6. 中国科学技术大学
7. 上海交通大学
8. 南开大学
9. 北京师范大学
10. 中国人民大学
11. 西安交通大学
12. 中山大学
13. 武汉大学
14. 哈尔滨工业大学
15. 天津大学
16. 华中科技大学
17. 北京航空航天大学
18. 大连理工大学
19. 厦门大学
20. 四川大学
21. 北京科技大学
22. 东南大学
23. 同济大学。
建议：
清华大学和北京大学在2006年并列第一，表现最为突出。
浙江大学、复旦大学和南京大学紧随其后，位列前三甲。
学科门类方面，北京大学在理学、医学、文学、法学、哲学五个学科门类中排名第一，清华大学在工学和管理学方面表现优异。