南京出名的大学包括：
南京大学
声誉与地位：南京大学是中国顶尖高校“华东五校”之一，也是国家“双一流”、“985工程”和“211工程”重点建设高校。南京大学在四轮学科评估中有3个A+学科、11个A类学科、7个A-学科，实力可见一斑。
历史沿革：南京大学的前身是创建于1902年的三江师范学堂，后历经两江师范学堂、南京高等师范学校、国立东南大学、国立第四中山大学、国立中央大学、国立南京大学等历史时期，于1950年更名为南京大学。
特色学科：南京大学天文学系是全国高校中历史最悠久、培养人才最多的天文学专业院系，拥有目前国内唯一的天文学一级重点学科。
南京理工大学
声誉与地位：南京理工大学是全国闻名的重点高校，隶属于工业和信息化部，是国家“双一流”建设高校、“211工程”和“985工程优势学科创新平台”建设高校。
历史沿革：南京理工大学起源于1949年，由中国人民解放军军事工程学院（哈军工）分建而成，北依紫金山，西临明城墙，是一所具有军工特色的重点高校。
这两所大学都是南京乃至全国知名的高等学府，各有其特色和优势学科。南京大学在人文社科和天文学领域具有深厚的历史底蕴和学术实力，而南京理工大学则在工科，特别是军工领域享有很高的声誉。