台湾台南大学的专业设置如下：
教育学院
教育学系
特殊教育学系
重度障碍研究所
辅助科技研究所
幼儿教育学系
体育学系
谘商与辅导学系
教育经营与管理研究所
测验统计研究所
人文与社会学院
国语文学系
英语学系（含进修学士班）
行政管理学系
文化与自然资源学系
台湾文化研究所
理工学院
应用数学系
经营与管理学系
电机工程学系
资讯工程学系
机电系统工程研究所
数位学习科技学系
材料科学系
环境与生态学院
绿色能源科技学系
生态科学与技术学系
生物科技学系
艺术学院
音乐学系
美术学系
戏剧创作与应用学系
动画媒体设计研究所
管理学院
经营与管理学系
行政管理学系
高阶管理硕士在职专班
此外，台南大学还有以下专业：
经济学
水生生物学
金融学
文艺学
会计学
新闻学
工程力学
眼科学
内科学
中国古代史
免疫学
国际关系
汉语言文学
生物技术
电子信息工程专业
计算机科学与技术
对外汉语
统计学
生物化学与分子生物学
生物医学工程
病理学与病理生理学
企业管理
建议根据个人兴趣和职业规划，选择适合的专业进行修读。