昌吉市拥有以下高中和大学：
大学：
昌吉学院 ：昌吉学院是一所区属普通高等学校，前身成立于1959年，2001年5月升格为本科院校。新疆农业职业技术学院：
昌吉职业技术学院是一所公办全日制普通高等职业院校，是新疆首批“示范性高职院校”。
昌吉职业技术学院：
昌吉职业技术学院是经国家教育部批准成立的一所公办全日制普通高等职业院校。
高中
昌吉州第一中学
昌吉州第二中学
昌吉州第四中学
昌吉市第一中学
昌吉市第四中学
昌吉市第九中学
行知学校
玛纳斯县第一中学
呼图壁县第一中学
阜康市第一中学
吉木萨尔县第一中学
奇台县第一中学
奇台县第二中学
木垒县第一中学
建议：
对于想要报考本科学校的学生，昌吉学院是一个不错的选择，它与其他知名大学有联合培养项目，提供了丰富的教育资源和机会。
对于高职（专科）院校的选择，新疆农业职业技术学院和昌吉职业技术学院都是自治区内较为优秀的院校，具有多个荣誉和认证，就业前景较好。
对于高中生而言，可以根据所在区域选择就近的高中，如昌吉市第一中学、昌吉州第一中学等，这些学校在历年高考中表现较好，师资力量和教育资源也较为丰富。