全国表彰奖项中获奖的大学包括：
石河子大学- 获得6项奖项。
华中科技大学- 获得5项奖项。
吉林大学- 获得5项奖项。
武汉大学- 获得2项一等奖。
浙江大学- 在2021年国家科技三大奖中获得5项，排名第一。
华南农业大学- 获得自然科学二等奖1项，技术发明二等奖1项，科技进步二等奖4项。
扬州大学- 获得自然科学二等奖1项，技术发明二等奖1项，科技进步二等奖3项。
首都医科大学- 在某些奖项中也有获奖记录。
清华大学- 在多个奖项中获奖，包括国家科技奖和人文社科优秀成果奖。
北京大学- 在人文社科优秀成果奖中获奖94项，排名第一。
中国人民大学- 在人文社科优秀成果奖中获奖85项，排名第二。
复旦大学、 西安交通大学、 中南大学、 东南大学- 在某些奖项中也有获奖记录。
以上信息根据最近的数据更新整理而来，具体获奖项目和年份请参考官方发布的最新公告