耶拿大学提供多个研究生专业，涵盖广泛的学科领域。以下是一些主要的研究生专业：
法学院
非洲历史专业
医学院
人类学
人体测量学与运动生理学
肿瘤学
临床生物化学
医德学
临床药物学
应用神经生物学
实验风湿病学
财政金融学院
政治经济学
银行法
药物学院
实验制药学
物理与自然科学学院
动物生物学
地球科学
企业经济学院
企业经济学
电子商务
信息技术
电子与信息技术学院
电气工程及自动化
光电工程
信息工程
仪器科学
软件工程
基础科学学院
数学
物理学
化学
生物化学
机械制造学院
机械工程
材料工程
医药与生物技术学院
药物化学
分子生物学
生物技术
健康和护理学院
护理学
健康科学
社会学和经济工程学院
社会学
经济学
经济教育学
其他学院
教育学
伦理学
地理学
地质学
计算机信息学
心理学
法律学
国民经济学
经济教育学
这些专业为学生提供了丰富的选择，涵盖了从人文学科到理工科等多个领域。建议申请者根据自身兴趣和职业规划，选择最适合自己的专业方向。