武汉大学拥有众多科研基地，涵盖了自然科学、工程技术、人文社会科学等多个领域。以下是一些主要的科研基地：
国家重点实验室
测绘遥感信息工程
水资源与水电工程科学
病毒学（联合）
杂交水稻（共建）
国家工程技术研究中心
国家多媒体软件
国家卫星定位系统
国家野外科学观测研究站
湖北梁子湖湖泊生态系统
武汉大气遥感
教育部人文社会科学重点研究基地
信息资源研究中心
社会保障研究中心
国际法研究所
环境法研究所
中国传统文化研究中心
媒体发展研究中心
教育部重点实验室
地球空间环境与大地测量
口腔生物医学工程
生物医用高分子材料
地理信息系统
人工微结构
水力机械过渡过程
生物医学分析化学
水工岩石力学
组合生物合成与新药发现
教育部工程研究中心
有机硅化合物及材料
建筑物检测与加固
植物生物技术与遗传资源利用
雷电防护与接地技术
时空数据智能获取技术与应用
高级综合研究机构
高级研究中心
国际问题研究院
其他科研基地
武汉大学离子束功能材料研究中心
武汉大学电子显微镜中心
武汉大学纳米科学与技术研究中心
武汉大学量子物质能量转换协同创新中心
武汉大学天体物理中心
武汉大学还有多个湖北省重点实验室、技术创新基地、校级和院级研究基地，以及科普基地等，为师生提供了丰富的科研资源和平台。