首都大学东京
首都大学东京（The University of Tokyo）是东京都内唯一一所公立的综合性大学，由东京都政府扶持投资建设。
在多个国际大学排名中，如2013年英国泰晤士高等教育世界排名、2014年QS世界大学排名、2016-2017年英国泰晤士高等教育世界排名中，该校在日本综合排名分别位于第7位、第15位、第9位。
大阪公立大学
大阪公立大学由原大阪市立大学和大阪府立大学合并而成，成为日本规模最大的公立大学之一。
在全国国公立大学中，学生人数位居第三，仅次于东京大学和大阪大学。
2025年QS世界排名已与中国的兰州大学等985、211高校对标。
筑波大学
筑波大学是日本最古老的大学之一，诞生于1872年，位于东京首都圈的筑波市。
该校是日本著名的国立综合大学，占地约258公顷，是日本面积最大的大学之一。
筑波大学在体育科技研究上处于世界领先地位，日本女排比赛时，该校研究员会对对手的作战情况进行数据分析。
东京工业大学
东京工业大学（Tokyo Institute of Technology）是日本理工科大学之最，专攻工程技术与自然科学。
该校在多个国际大学排名中表现优异，如2016年英国泰晤士高等教育世界排名中，该校在日本综合排名位于第9位。
一桥大学
一桥大学是日本很早建立的大学之一，也是一所纯文科类院校，被誉为“亚洲的哈佛”。
在2025年QS日本大学排名中，该校位于第14位，世界排名539位。
御茶水女子大学
御茶水女子大学是日本第一所女子大学，位于东京，地理位置优越，文科专业相对集中，尤其是女性研究方面具有独特的优势。
在2025年QS世界排名中，该校位于第43位。
芝浦工业大学
芝浦工业大学在日本的口碑较好，具体排名可以参考2025年QS日本大学排名，该校位于日本私立14名（全国49）。
熊本大学
熊本大学在日本的排名在20名左右，优势学部是医学部，属于日本头部水平。
在2025年QS世界排名中，该校位于第951-1000位。
这些大学虽然在国际排名中的位置相对较高，但在国内可能相对较少人了解，因此可以被认为是“隐藏”的高排名大学。建议对特定学科或领域有兴趣的学生可以进一步了解这些大学的具体专业和优势。