根据提供的信息，以下是部分日本农业大学及其第一年支付总费用的排名情况：
1. 日本大学 - 生物资源科学部（食品商务、国际地域开发） - 1,190,000日元
2. 东京农业大学 - 国际食品情报学科（国际农业开发除外） - 1,293,400日元
3. 东京农业大学 - 生物产业（北海道）学部（地域产业经营） - 1,296,400日元
4. 酪农学园大学 - 农产品环境学群（食物和健康） - 1,309,000日元
5. 酪农学园大学 - 兽医学群（兽医保健看护） - 1,317,500日元
请注意，这些费用信息可能已经有所变动，建议直接咨询相关大学或访问其官方网站获取最新信息。如果您需要了解更多关于日本农业大学的排名或其他信息，请告诉我