滑铁卢大学拥有众多实验室和研究机构，以下是一些主要的实验室：
会计研究与教育中心
应用保健研究中心
信息理论中心
分子束与激光化学中心
新牛津英语词典中心（用计算机编辑）
职业写作中心
社会、技术与价值中心
圭尔夫/滑铁卢生物技术中心
遗传资源中心
计算机研究所
地下水研究所
提高质量与生产率研究所
高分子研究所
风险研究所
多孔介质研究组
第四纪科学研究所
太阳热工程中心
滑铁卢纳米技术研究所
滑铁卢人文研究团体
滑铁卢计算机集成电路制造中心
滑大过程开发中心
滑铁卢核磁共振中心
滑铁卢研究所
滑铁卢量子
Reading to Learn （R2L） 实验室
这些实验室涵盖了从基础研究到应用研究的多个领域，包括计算机科学、工程技术、生物科学、社会科学等。学生可以通过参与这些研究项目，培养创新精神和领导能力。