东京大学
东京大学（The University of Tokyo），简称东大，是一所位于东京都文京区的综合性国立大学，也是日本特别高学府。其博士课程每年学费为520,800日元，折合人民币大约2.6万元。
京都大学
京都大学（Kyoto University），简称京大，是一所位于京都市左京区的综合性国立大学，在日本仅次于东京大学。其博士课程每年学费为535,800日元，折合人民币大约2.7万元。
东京都立大学
东京都立大学（Tokyo Metropolitan University），简称东京都大，是一所位于东京都八王子市的公立综合性大学，由东京都政府出资设立。其博士课程每年学费为520,800日元，折合人民币大约2.6万元。
庆应义塾大学
庆应义塾大学（Keio University），简称庆大，是一所位于东京都港区的著名私立大学。其博士课程在文商科和理工医药方面都有优势。
早稻田大学
早稻田大学（Waseda University），是一所位于东京都新宿区的著名私立大学，留学生人数居日本所有大学之首。其博士课程在法学、商学、理工学方面都有优势。
一桥大学
一桥大学（Tōyō University），是一所专攻人文学与社会科学的小规模精英院校，被誉为“亚洲的哈佛”。其博士课程在经济学、社会学、商学、文学方面都有优势。
大阪大学
大阪大学（Osaka University），是一所位于大阪府大阪市的世界级综合性国立大学，QS世界排名68位。其博士课程涵盖多个学科领域。
神户大学
神户大学（Kobe University），是一所位于兵库县神户市的著名研究型国立大学，日本排名13位。其博士课程在经营学、经济学、法学等领域有优势。
东北大学
东北大学（Tohoku University），是一所位于宫城县仙台市的国立大学，日本排名前十位。其博士课程在医学、工学、理学等领域有优势。
名古屋大学
名古屋大学（Nagoya University），是一所位于爱知县名古屋市的国立大学，日本排名前十位。其博士课程在医学、工学、理学等领域有优势。
北海道大学
北海道大学（Hokkaido University），是一所位于北海道札幌市的世界级综合性国立大学，帝国大学之一。其博士课程在新闻与媒体研究科等方面有优势。
这些大学在各自的领域都有很高的学术声誉和研究实力，提供多种博士课程供学生选择。建议根据个人兴趣和研究方向选择合适的大学进行申请。