在重庆，以下大学的专业被认为是最好的：
重庆大学 王牌专业：
机械工程、电气工程、土木工程
热门专业：金融、会计、计算机、电子信息和自动化
国家特色专业：生物工程、软件工程、测控技术与仪器、电子信息工程、电气工程及其自动化、车辆工程、建筑学、计算机科学与技术、采矿工程
学科评估：电气工程、机械工程、仪器科学与技术评为A类
西南大学 王牌专业：
教育学、心理学
热门专业：计算机科学与技术
国家特色专业：无明确列出，但在农业、生命科学等领域声名远扬
学科评估：无明确列出，但在教育学、心理学等领域有较高声誉
重庆邮电大学 王牌专业：
计算机科学与技术、通信工程、微电子科学与工程
热门专业：信息管理与信息系统、智能科学与技术、微电子科学与工程
国家特色专业：软件工程、通信工程、信息管理与信息系统、计算机科学与技术、智能科学与技术、微电子科学与工程
学科评估：无明确列出，但在信息通信领域有较高声誉
重庆交通大学 王牌专业：
土木工程、港口航道与海岸工程、交通运输
热门专业：水利工程、土木工程、交通运输工程、管理科学与工程
国家特色专业：土木工程、港口航道与海岸工程、交通运输
学科评估：土木工程、港口航道与海岸工程、交通运输评为B+类
重庆医科大学 王牌专业：
临床医学、口腔医学
热门专业：医学检验、病理检验、预防医学、法医学、高原军事医学
国家特色专业：无明确列出，但在医药类高等学府中占据重要地位
学科评估：临床医学等学科排名全国前列
陆军军医大学 王牌专业：
临床医学、医学检验、病理检验、预防医学、法医学、高原军事医学
热门专业：无明确列出，但以军事医学为特色
国家特色专业：无明确列出，但在军事医学领域有较高声誉
学科评估：无明确列出，但在军事医学领域有较高声誉
建议
重庆大学和 西南大学在多个王牌专业上都有很高的声誉和实力，建议根据个人兴趣和职业规划选择。
重庆邮电大学和 重庆交通大学在理工科领域表现突出，特别是计算机科学与技术、通信工程和土木工程等专业，适合对理工科有浓厚兴趣的学生。
重庆医科大学在医药领域具有显著优势，特别是临床医学和口腔医学，适合有志于从事医学工作的学生。
陆军军医大学则专注于军事医学，适合有军人梦想或对军事医学感兴趣的学生。