上海科技大学在多个领域取得了显著的研究成果，以下是一些主要成果：
拓扑物理研究
陈宇林-陈成团队利用纳米角分辨光电子能谱（Nano-ARPES）技术，在超导魔角石墨烯中发现了显著的谷间-电声子耦合效应，并确定了相应的声子模式。这一发现对理解魔角石墨烯的超导机理具有重要意义，并可能对量子计算应用产生影响。
免疫化学研究
饶子和院士研究团队成功解析了分枝杆菌关键的阿拉伯糖基转移酶复合体的三维结构，揭示了抗结核药物乙胺丁醇的作用机制。这是自乙胺丁醇问世半个多世纪以来，科学家首次从分子水平上破解这一抗结核“传统老药”的抑菌机制。
人工智能与研究生教育
上海科技大学在人工智能创新型研究生培养方面取得重要突破，项目荣获上海市高等教育优秀教学成果（研究生）一等奖。
教学成果
上海科技大学申报的“全方位､全流程”研究创新型本科人才培养的探索与实践项目获上海市高等教育优秀教学成果（本科）特等奖。
生命科学研究
向阳飞课题组在《Cell Stem Cell》上发表论文，利用人类多能干细胞构建了首个自组织的人类神经肌肉骨骼类器官（hNMSOs），为研究人类神经肌肉骨骼轴及相关疾病提供了人源体外模型。
病毒学研究
饶子和团队与清华大学联合团队解析了新冠病毒mRNA加帽、基因组复制矫正、逃逸核苷类抗病毒药物的分子机制，该成果入选《中国2021年度重要医学进展》。
光学成像技术
任无畏教授团队在荧光成像领域取得多项进展，提出了一种多功能光学断层扫描系统（SHMOT），用于肿瘤诊断和神经科学研究。
基因编辑技术
季泉江教授团队开发了具有自主知识产权的Cas12f和Cas12n等超小型基因编辑器，并正在开发针对遗传病、慢性病和传染病的体内基因治疗管线。
这些成果展示了上海科技大学在物理学、免疫化学、人工智能、生命科学研究等多个领域的突出表现和重要贡献。