日本的三大理工大学排名如下：
东京大学
东京大学是一所本部位于日本东京都文京区的世界级著名研究型综合大学，作为日本最高学术殿堂和七所旧帝国大学之首，在全球享有极高的声誉。在2018年发布的QS世界大学排名中，东京大学位列世界第28名，日本第1名。
京都大学
京都大学是一所本部位于日本京都市左京区的日本顶尖研究型大学，学科齐全、规模宏大，在日本仅次于东京大学。在2018年发布的QS世界大学排名中，京都大学位列全球第35名，日本第2名。
东京工业大学
东京工业大学是日本理工科大学之最，专攻工程技术与自然科学，是日本超级国际化大学计划（Top Global University Project）A类顶尖校之一。在2018年发布的QS世界大学排名中，东京工业大学位列世界第56名，日本第3名。
建议：
东京大学在整体排名和日本国内排名中均位居第一，表现出极强的学术实力和国际影响力。
京都大学在科研综合实力和学术声望方面也非常高，尤其在理学和工学领域有着卓越的成就。
东京工业大学在工程技术类排名中表现突出，是日本乃至世界一流的理工科大学。
这三大理工大学各有优势，建议根据个人兴趣和职业规划选择合适的大学。