清华大学在数学教学和研究中使用了多种软件工具，以下是一些常用的工具：
Eclipse：
这是一款开源的集成开发环境（IDE），广泛应用于Java编程。Eclipse具有丰富的插件和工具，支持代码编辑、调试、版本控制等功能，非常适合学习和开发Java程序。
PyCharm：
这是一款专门用于Python开发的IDE，在清华大学的Python编程教学中经常使用。PyCharm具有智能代码提示、调试功能、版本控制等特点，适用于Python程序的开发和调试。
Visual Studio：
这是微软推出的一款强大的集成开发环境，广泛用于多种编程语言的开发。清华大学在一些课程中使用Visual Studio进行C++和C编程。它提供了丰富的工具和插件，支持代码编辑、调试、图形界面设计等功能。
MATLAB：
这是一款高级的数学软件，常用于科学计算和工程分析。清华大学的一些课程中使用MATLAB进行数值计算和数据分析。MATLAB具有强大的数学函数库和绘图功能，适合进行数学建模和算法实现。
RStudio：
这是一个专门用于R语言开发的集成开发环境。清华大学的统计学课程中常用R进行数据分析和统计建模，而RStudio是R语言的一个优秀开发工具，提供了代码编辑、调试、数据可视化等功能。
这些工具在数学教学和研究中发挥了重要作用，帮助师生更高效地进行编程和数学计算。建议根据具体课程和研究需求选择合适的工具。