墨脱县目前有以下几所大学学院参与合作或建立基地：
浙江大学生命科学学院：
与墨脱县合作，建立了社会实践基地和思政教育基地。
西藏大学：
参与了对墨脱县生物多样性的研究。
西南大学：
同样参与了墨脱县的生物多样性研究。
深圳大学：
与墨脱县合作，聚焦生物多样性调查。
华南农业大学园艺学茶学系：
与墨脱县建立了研究生联合培养基地，专门招录了与墨脱县联合培养的第一位研究生。
西藏自治区高原生物研究所：
与墨脱县合作，共同组建了墨脱生物多样性西藏自治区野外科学观测站。
以上信息显示，墨脱县与多个高等教育机构有科研合作和人才培养方面的交流，共同推动当地生物多样性研究和生态文明建设