重点大学中与铁路局有良好合作关系的院校包括：
北京交通大学
教育部直属，共建高校包括教育部、北京市人民政府、中国铁路总公司。
“211工程”、“985工程”优势学科创新平台建设高校。
历史悠久，与铁路系统关系密切。
西南交通大学
教育部直属，共建高校包括教育部、铁路总局等。
“双一流”、“211工程”、“特色985工程”重点建设高校。
在交通工程、通信工程等领域具有特色。
华东交通大学
江西省属重点大学，共建高校包括中国国家铁路集团有限公司、国家铁路局与江西省人民政府。
以交通为特色，轨道为核心。
与南昌铁路局等省级铁路局关系良好。
大连交通大学
国家铁路局和辽宁省共同建设高校。
特色专业包括车辆工程、轨道交通信号与控制、软件工程等。
与沈阳铁路局、大连地铁等大单位有合作关系。
兰州交通大学
甘肃省高水平大学建设院校。
特色专业有交通运输、土木工程、机械工程。
毕业生在铁路局及其他国企有广泛的就业机会。
石家庄铁道大学
国防科工局、国家铁路局、教育部等多方共建高校。
土木工程、交通运输工程、桥梁隧道等专业强势。
毕业生在铁路系统就业率高。
以上信息根据最近更新的数据整理而来，具体情况可能会随着时间和政策的变化有所调整。