日本大学的历史课程通常涵盖多个领域，主要包括但不限于以下几个方向：
日本史：
研究日本的各个历史阶段，特别是古代史和中世史。
东方史：
关注亚洲其他国家和地区的历史，如中国、台湾、朝鲜和东南亚国家。
东亚史：
研究东亚地区的历史，包括日本、中国和韩国等国家。
伊斯兰史：
探讨伊斯兰世界的历史和文化。
西洋史：
研究欧洲的历史，从地中海世界到现代欧洲的形成。
考古学：
研究古代文明和遗迹，如日本古坟时代的考古。
这些课程旨在培养学生广阔的视野，掌握正确的历史研究方法，并为成为研究者或教育者打下基础。学生可以选择通史或断代史研究，并可能涉及历史材料的真实性、可信性和完整性，历史学理论框架，以及道德评价等方面的研究。
日本的一些顶尖大学，如东京大学和京都大学，提供丰富的历史学研究课程，涵盖日本及全球范围内的历史与文化。