当前南阳市内被认为是一流中医药高校的主要有：
张仲景国医大学：
这所大学在历史上曾是我国第一所中医高校，并且在国际上有一定的认可度。目前，张仲景国医大学的复建工作正在顺利推进，并计划在未来发展成为双一流大学。
河南国医学院：
这所学院是在南阳市独立设置的，定位为教学科研型中医药高校，计划到2027年设置专业总数达16个。
南阳医学高等专科学校：
这所学校是一所以西医为主体、中医为特色的省属全日制医学类普通高等专科学校，并且是河南省博士后研发基地。
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