三本和本科职业技术大学是两种不同类型的高等教育机构，它们之间存在明显的区别：
办学层次
三本：三本院校指的是经教育部批准设立的独立学院、民办本科高校等，它们属于本科层次。本科学历对考生今后的深造和发展比较有利，三本院校的合格毕业生能直接考研，招录公务员时大部分单位也要求具有本科及以上学历。
本科职业技术大学：本科职业技术大学是近年来兴起的本科层次职业学校，它们提供本科层次的教育，但侧重于职业技能的培养和实践能力的提升。
专业设置与就业
三本：三本院校的专业设置通常较为广泛，涵盖多个学科领域。由于办学时间一般较短，一些独立学院依托母体院校的支持，逐渐形成自己的办学特色。
本科职业技术大学：这类大学的专业设置通常与市场需求紧密相关，注重学生实践能力的培养，专业更新较快，以适应劳动力市场的变化。
收费情况
三本：三本院校的收费普遍较高，一年学费可能相当于一般高职三年的学费。
本科职业技术大学：相比三本，本科职业技术大学的收费较低，更有利于有经济压力的家庭。
升学与就业
三本：三本院校的毕业生可以继续考研或参加公务员考试，但就业时可能面临一定的竞争压力，因为本科学历在求职市场上具有一定的优势。
本科职业技术大学：毕业生不仅具备直接适应岗位工作的能力，还可以通过专升本等方式继续深造，就业方向更明确，更受企业青睐。
建议
选择三本还是本科职业技术大学：
如果考生追求更高的学历和更广泛的学术背景，可以考虑报考三本院校。
如果考生希望快速就业，具备较强的实践能力，并且家庭经济条件允许，本科职业技术大学是一个更好的选择。
关注政策变化：
近年来，国家大力支持职业教育的发展，本科职业技术大学的设立和申报越来越受到重视。考生和家长应关注相关政策变化，以便做出更合适的选择。
通过以上分析，可以看出三本和本科职业技术大学各有其优势和特点，选择哪一类学校应根据个人的职业规划、兴趣及家庭经济状况综合考虑。