东京大学：
作为日本第一学府，东京大学的化学专业极其强势，化学系在理学科和工学科中都有分布，便于学生选择相关交叉学科。此外，东京大学化学专业对留学生的态度积极，是一个综合学习的理想选择。
京都大学：
京都大学的化学系拥有百年历史，早在帝国大学时代就有化学部。该专业在诺贝尔奖获得者数量上居日本前列，并且国际交流频繁，有利于学生拓宽国际视野。
东京工业大学：
被誉为日本“麻省理工”的东京工业大学，在化学方面有很强的实力，化学系隶属于物质理工学院，应用化学系备受推崇。学校每年在化学方面的投入大，重视理论与实践的结合。
大阪大学：
大阪大学的化学专业实力强，拥有构造热科学研究中心，研究范围广泛，从衣食住行等细微方面入手，致力于将研究成果应用于生活便利性提升。
名古屋大学 、 东北大学、 九州大学、 北海道大学、 庆应义塾大学、 东京理科大学、 早稻田大学、 筑波大学、 广岛大学、 千叶大学、 神户大学、 横滨国立大学、 金泽大学、 奈良先端科学技术大学院大学、 东京都立大学、 北陆先端科学技术大学院大学、 冈山大学、 信州大学：
这些大学也在化学专业方面有着较高的教学和研究水平。
建议根据个人兴趣、研究方向及未来职业规划，选择合适的大学进行申请。