南京大学的专业拆分主要基于CHES的评估，分为A、B、C三个等级，具体拆分如下：
A类
主要包括哲学、经济学、法学、教育学、文学、历史学、理学、工学、农学、医学、管理学、艺术学等。这些专业被认为是南京大学最高等级的专业。
B类
主要包括建筑学、地理学、环境科学、水利水电工程、材料科学与工程、机械工程、电子信息工程、计算机科学与技术、生物科学、农业工程、统计学等。这些专业是南京大学中等等级的专业。
C类
主要包括一些较低等级的专业，具体专业未详细列出。
此外，南京大学在本科阶段还有一些特殊的专业分流，例如数理大类在本科阶段分流为数学科学学院和物理科学学院：
数学科学学院：
设有数学分析、高等代数、解析几何、微分几何、复变函数与实变函数、泛函分析、数学物理方程、计算数学等七个专业方向。
物理科学学院：
设有物理学（光电物理与器件方向）、物理学（凝聚态方向）、物理学（高能物理与天体物理方向）三个专业方向。
这种拆分方式有助于学生根据自己的兴趣和职业规划选择更适合的专业方向，同时也有利于学校更好地进行教学和管理。