约翰·F·肯尼迪总统在生前和去世后，以他的名字命名了多个教育机构和设施，其中包括：
哈佛大学肯尼迪政府学院（Harvard Kennedy School, HKS）
简称肯尼迪学院，是哈佛大学的研究生学院之一，专注于公共政策、公共管理、国际发展等领域的研究。
芝加哥城市学院-肯尼迪国王学院（City Colleges of Chicago-Kennedy-King College）
位于伊利诺伊州芝加哥市，是一所公立社区学院，提供副学士学位和其他文凭课程。
约翰·F·肯尼迪大学（John F. Kennedy University）
位于加利福尼亚州普利斯坦特山，是一所成人教育高等学校。
肯尼迪理工学院（Kennedy Institute of Technology）
位于加拿大多伦多市，是一所快速成长的院校，提供学士及硕士学位。
约翰·F·肯尼迪表演艺术中心（John F. Kennedy Center for the Performing Arts）
位于华盛顿特区，是一个著名的表演艺术中心。
约翰·肯尼迪图书馆（John F. Kennedy Library and Museum）
位于美国，是一个图书馆和博物馆，用全球捐款建造。
这些机构以肯尼迪总统的名字命名，以纪念他对美国及全球社会所做的贡献，并在各自的领域内提供教育和研究服务