闽南师范大学的专业设置如下：
文学院
中国语言文学
汉语言文学
汉语国际教育
理学院
数学与应用数学
经济学院
经济学
经济统计学
经济与金融
法学院
法学
政治与行政学院
政治学与行政学
社会学院
社会工作
外国语学院
英语
商务英语
日语
翻译
新闻传播学院
广播电视学
广告学
广播电视编导
教育科学学院
教育学
心理学
历史与哲学学院
中国古代文学
中国现当代文学
文艺学
课程与教学论
外国语学院
英语
商务英语
日语
翻译
新闻传播学院
广播电视学
广告学
广播电视编导
艺术与设计学院
美术学（师范）
音乐学（师范）
公共艺术（闽台合作项目）
数学与统计学院
数学与应用数学
经济统计学
物理与光电工程学院
计算机科学与技术
化学与生命科学学院
应用心理学
地理与遥感学院
地理科学
海洋科学学院
海洋科学
生命科学学院
生物科学
商学院
国际经济与贸易
经济学
经济与金融
管理学院
财务管理
人力资源管理
市场营销
国际交流与合作学院
国际商务
物理与光电工程学院
计算机科学与技术
化学与生命科学学院
应用心理学
地理与遥感学院
地理科学
海洋科学学院
海洋科学
生命科学学院
生物科学
商学院
国际经济与贸易
经济学
经济与金融
管理学院
财务管理
人力资源管理
市场营销
国际交流与合作学院
国际商务
31. 海洋科学学院：
海洋科学
32. 生命科学学院：
生物科学
33. 商学院：
国际经济与贸易
经济学
经济与金融
34. 管理学院：
财务管理
人力资源管理
市场营销
35. 国际交流与合作学院：
国际商务
36. 海洋科学学院：
海洋科学
37. 生命科学学院：
生物科学
38. 商学院：
国际经济与贸易
经济学
经济与金融
39. 管理学院：