建水地区的高等教育机构包括：
红河学院：
位于红河哈尼族彝族自治州建水县，是一所本科院校，前身为建水师范学校。
滇西应用技术大学建水学院：
拥有优秀的师资力量和现代化的教育设施，注重培养学生的实践能力和创新能力。
红河学院紫陶学院（建水校区）：
专注于紫陶文化的教育与研究，位于红河哈尼族彝族自治州建水县临安镇阜安路379号。
红河职业技术学院建水校区：
举办有“建水紫陶产业学院”，是云南省首家紫陶产业学院。
东南大学：
虽然东南大学位于江苏省南京市，但曾与建水实验中学合作开展教育交流活动，探索中高衔接教育。
大连海事大学：
位于辽宁省大连市，是一所重点建设的大学，与建水实验中学有招生宣讲方面的合作。
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