日本拥有化学专业的大学包括：
东京大学：
作为日本第一学府，东京大学的化学专业非常出色，化学专业分布在理学科和工学科中。
京都大学：
京都大学的化学系拥有悠久的历史，早在帝国大学时代就有化学部，化学部与大学共同成长，并且有多位诺贝尔奖获得者。
东京工业大学：
作为工科类专属大学，东京工业大学在化学方面有很强的实力，应用化学系隶属于物质理工学院，涵盖应用化学、资源、生命工程、原子核工学和地球生命等多个方向。
大阪大学：
大阪大学的化学专业隶属于理学部，应用化学专业隶属于工学部，化学专业拥有构造热科学研究中心，研究范围广泛，涉及衣食住行等生活方面。
这些大学在化学专业方面都有很高的声誉和学术实力，建议根据个人兴趣和职业规划选择合适的大学进行申请。