日本王牌大学通常指的是那些在国际上有较高声誉和排名的大学，以下是一些日本顶尖的大学，它们在各自的领域有着卓越的表现和影响力：
S级大学 - 国际超一流大学
东京大学：日本及亚洲地区排名最高的学府，世界前50的大学之一。
京都大学：亚洲排名第2，世界排名前30，属于超一流大学。
A级大学 - 国际一流大学
大阪大学：在基础工学、人际学和社会学等领域有优势。
名古屋大学：在医学、数学、环境学等学科享有盛誉。
东京工业大学：被称为亚洲的麻省理工，专攻工程技术与自然科学领域。
一桥大学：日本商科大学，以人文及社会科学领域的小规模精英大学著称。
庆应义塾大学：日本最古老的私立综合性大学，以经济学、医学、文学等享誉全国。
B级大学 - 国内一流大学
筑波大学：理工工科较强，是日本国立综合研究型大学之一。
早稻田大学：与庆应义塾大学并称“日本私学双雄”，是日本一流的高等学府。
其他著名大学
东北大学：在材料学、物理学、通信等领域有着世界一流的水平。
北海道大学、 九州大学：都是日本历史悠久且学术水平高的综合性国立大学。
这些大学在各自的领域有着卓越的成就和广泛的国际影响力，是日本高等教育的重要组成部分。