日本漫画专业最强的大学包括：
京都精华大学：
京都精华大学是日本第一所建立漫画专业的大学，也是全球第一所设立漫画专业的大学。该校的漫画专业在日本排名第一，拥有优秀的教授阵容，并且以研究漫画和发展漫画事业为目的创立了日本第一个漫画研究科。京都精华大学的漫画专业不仅注重实践技能的培养，还深入探讨漫画理论，是日本漫画家和动漫制作者的摇篮。
东京艺术大学：
东京艺术大学是日本国内历史最悠久的艺术大学之一，在立体动画和动画企划领域有非常专业的教授，培养了很多新锐动画师。该校的动画风格偏向艺术和实验领域，注重培养学生独特的艺术感性。
多摩美术大学：
多摩美术大学是日本规模最大的顶级美术大学之一，与武藏野美术大学、东京艺术大学并称为“御三家”。该校崇尚“自由与意力”的教育理念，小班制教学，注重通过与学生直接交流实现教育目标。
东京工艺大学：
东京工艺大学是本部位于日本东京都中野区的工学和艺术类私立大学，有动画和媒体和漫画媒体两个动漫相关课程。该校的漫画学科把故事性的漫画表现作为核心，同时也设置课程使学生掌握卡通、插画、剧本、杂志书籍编辑等相关领域的专门技术与知识。
大阪艺术大学：
大阪艺术大学在角色造形学科方面有着显著优势，学生能够专注于学习塑造极富魅力的角色，不断见证新主人公的诞生。
这些大学在漫画专业方面都有各自的特色和优势，建议根据个人兴趣和职业规划，选择最适合自己的大学进行深入学习。