奎屯市拥有以下几所大学：
奎屯开放大学：
成立于1984年4月，是一所专注于成人教育的大学，提供成人本科、专科、中专学历教育。
伊犁师范大学（北校区）：
是一所普通高等师范学校，前身是1948年成立的新疆省立伊犁专科学校，后经过发展，于2018年12月更名为伊犁师范大学。
新疆兵团农七师行政学院：
提供行政管理的教育和培训。
新疆应用职业技术学院：
是一所针对职业技术教育的综合性大专院校，由伊犁州教育学院、伊犁州技工学校、宜州艺术学院、宜州建筑学校等学校合并成立。
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