卢旺达的高等教育机构包括公立和私立大学，以下是一些主要的高等院校：
公立大学
卢旺达国立大学 （University of Rwanda, UR）
综合性高等学校，是卢旺达最大的高等教育机构。
包含多个学术部门，如科学与技术学院、医学与健康科学学院、教育学院、商业与经济学院、社会科学学院等。
高等农业和畜牧业学院
基加利卫生学院
基加利科学技术学院
基加利教育学院
公共法语高等学院
私立大学
基特瓦教育学院
中非基督复临大学
基加利自由大学
尼亚基邦达大神学院
布塔雷神学新教学院
基加利基督复临非教会大学
研究所
农业和科技研究所
基加利高等体育学院
基加利高等研究院
基加利理工乌穆塔拉理工大学
基加利金融和银行学院
卢旺达大学提供多学科教育，致力于培养具有全球竞争力的人才，并通过学术研究与社会服务相结合，推动国家发展及区域合作与创新。