在郓城县，目前存在的大学有：
菏泽学院：
是一所全日制普通本科高校，位于菏泽市，是菏泽本地的高校。菏泽学院的前身是创建于1949年的冀鲁豫区第二师范学校，历史上曾更名为平原省立菏泽师范学校、山东省菏泽第一师范学校、菏泽师范专科学校。学校建有4个校区，占地面积1436亩，建筑面积63万余平方米，设有21个教学单位，开设66个本科专业；有在职教职工1696人，其中专任教师1211人，全日制本专科在校生2.6万余人。学校地址：北校区位于山东省菏泽市牡丹区大学路2269号，东校区位于山东省菏泽市中华路1166号，郓城分校位于山东省菏泽市郓城县东门街南段9号，单县分校位于山东省菏泽市单县文化路30号。
齐鲁工业大学菏泽校区：
该校区是齐鲁工业大学的一个分院，是山东省人民政府批准设立，菏泽市人民政府为建设主体。学校位于中国牡丹之都山东省菏泽市，学校创办于2014年。校区占地面积约568亩，建筑面积约16.65万平方米，是菏泽最知名的高校之一，该校以培养本科及以上层次人才为主。目前，菏泽校区有3500余名在校生。学校地址：山东省菏泽市牡丹区北外环路1999号。
菏泽医学专科学校：
是一所省属公办全日制普通高等医学专科院校，隶属山东省卫生健康委员会领导和管理，接受省教育厅的管理和指导。
建议：
菏泽学院郓城分校：正在建设中，预计将投入使用，可以关注相关官方信息以获取最新进度。
康复大学：与郓城一中举行授牌仪式，表明康复大学在郓城县有一定的合作和发展。
郓城工匠学院：作为山东省第一批省级工匠学院，专注于工匠精神培养和职业技能发展。