古代日本并没有现代意义上的大学排名系统，因为排名的概念是近现代随着高等教育体系的标准化和国际化而逐渐形成的。不过，古代日本确实有一些著名的学府，如东京大学、京都大学等，它们在日本乃至世界历史上都享有极高的声誉。
东京大学（The University of Tokyo）
成立于1877年，是日本第一所国立大学，也是亚洲最早的西制大学之一。
设有多个校区，涵盖广泛的学科领域，包括法学、理学、文学、医学等。
培养了多位日本首相、诺贝尔奖得主以及其他国际奖项获得者。
京都大学（Kyoto University）
成立于1897年，是日本第二所旧制帝国大学，以独立思考和判断能力为教育宗旨。
设有10个学部，覆盖文学、经济学、医学、法学、理学、农学等领域。
大阪大学（Osaka University）
日本著名综合性研究型国立大学之一。
名古屋大学（Nagoya University）
位于日本爱知县名古屋市，是一所一流的综合研究型国立大学。
东北大学（Tohoku University）
位于日本宫城县仙台市，是日本著名的国立大学之一。
北海道大学（Hokkaido University）
成立于1876年，是日本首座授予学士学位的大学，以理工农医及社会学科研究水平全日本一流著称。
九州大学（Kyushu University）
本部位于日本福冈市，是一所一流的综合研究型国立大学。
东京工业大学（Tokyo Institute of Technology）
以工程技术与自然科学研究为主的世界一流理工大学之一。
筑波大学（University of Tsukuba）
前身为东京师范学校，成立于1973年，是新型的大学代表。
这些大学在日本乃至全球都享有极高的声誉，并在各自的领域有着重要的影响。