哈佛大学有一个独立的神学院，提供神学研究硕士专业（Master of Theological Studies, MTS）。该专业是一个为期两年的全日制学位，旨在使学生能够深入和广泛地探索各种神学领域和宗教传统的语言、文献、思想、制度、实践、规范要求以及结构等。学生还将有机会与他们的导师和课程委员会主席协商设计自己的主要研究领域。
专业课程包括：
1. 宗教研究的理论和方法（Theories and Methods in the Study of Religion）
2. 跨国视角下的宗教、性别和政治（Religion, Gender, and Politics in Transnational Perspective）
3. 伊斯兰神秘传统介绍（Introduction to Islamic Mysticism）
此外，该专业毕业生将表现出对一种以上宗教传统的语言、文学、思想、制度、实践、规范性主张和结构的广泛了解，并掌握一种以上的宗教研究方法。他们还将能够评估宗教学术研究中的一些主要理论和方法，并能够分析宗教研究与其他学术和专业学科之间的联系。毕业生将能够利用对宗教的理解，创造性和批判性地参与教育、艺术、法律、医学、新闻、社会服务或社会变革等领域的当代实践。