同济大学在其发展过程中，合并了多所高校，具体包括：
上海铁道大学：
上海铁道大学及其前身上海铁道学院在1996年合并，并在2000年4月11日完全并入同济大学。
上海城建学院：
上海城市建设学院在1996年并入同济大学。
上海建材学院：
上海建筑材料工业学院在1996年并入同济大学。
上海航空工业学校：
2003年，上海航空工业学校划归同济大学管理。
江南工学院：
原江南工学院（原名南洋公学）在1952年全国院系调整后并入同济大学。
同济医学院：
原同济医学院（原名上海德和医院医学堂）在1952年全国院系调整后并入同济大学。
大夏大学：
原大夏大学（原名圣约翰大学）在1952年全国院系调整后并入同济大学。
私立大厦大学 和 光华大学的土木工程系：在1951年合并到同济大学土木工程系。
交通大学、复旦大学、圣约翰大学等高校的相关专业：
在1952年全国院系调整后，这些高校的相关专业也并入同济大学。
这些合并增强了同济大学的学科实力，特别是在土建、建筑、交通、航空等专业领域。通过这些合并，同济大学从一个以土建为主的工科大学转变为一个理工为主的综合性大学，并在国内外享有更高的声誉。