日本大学本科专业目录大致可以分为以下几大类：
人文社会学类
文学类
社会学
哲学·思想文化学
伦理学
中国哲学
印度哲学
日本史学
东洋史学
西洋史学
考古学
心理学
人文地理学
日本语学
日本文学
比较文学
中国文学
英米文学
德国文学
法国文学
美学·文艺学
音乐学·演剧学
美术史学
言语学
语言学
美术·设计·艺术系统
音乐系统
教育学类
学校教育
幼儿教育
教科教育（国语、社会、数学、理科、英语、音乐、体育、家政）
科学文化教育系
言语文化教育系（日本语）
生涯活动教育系
人间形成基础系
教育心理学系（人间行动、心理临床）
教育学
教育行政学
心理教育学
特殊教育学
基督教教育学
人类学
教育社会学
社会教育学
人类形成学
教育科学
心理人间学
小学校课程
初等教育教员养成课程
学校心理
中学校课程
高等学校课程
特别教科课程（看护、美术工艺、数学、理科、音乐、保健体育）
盲学校课程
聋学校课程
看护学校课程
言语障碍儿教育教员养成课程
病虚弱儿教育教员养成课程
幼稚园课程
经管类
经济学
经济政策学
商学
经营学
会计学
专门职（MBA、MOT）
经济经营学科
经济理论
统计学
现代经济
经济史
法学类
法律学
政治学
应用实务法学
法学
政治学科
法律学科
管理行政学科
公共政策学科
工学类
建筑学
土木工学
电子情报工学
物质化学工学
地球环境工学
能源科学
机械航天工学
海洋工学
机械工学
航天宇宙工学
电气工学
精密工学
计数工学
化学生命工学
社会基盘学科
都市工学科
机械工学科
机械情报工学科
精密工学科
数学科
物理学科
化学科
信息科学科
建筑学科
市町づくり工学科（城市规划）
土木工建科
海洋建筑工学科
机械工学科
精密机械工学科
航空太空工学科
电气工学科
电子资讯工学科
物质应用化学科
管理工学
数理资讯工学科
土木工学科
建筑学科
机械工学科
电_电子工学科
土木工学科
建筑工学科
应用分子化学科
理学类
物理学
化学
地球惑星科学
数学
生物学
数理科学
生命理学
应用化学
生物学基础
化学基础
医学类
医学
生命科学
保健学
兽医学
医学部
医学科
学科
松__学部
学科
生物资源科学部
兽医学科
生命化学科
植物资源科学科
动物资源科学科
食品经济学科
森林资源科学科
海洋生物资源科学科
生物环境工学科
食品生命学科
国际地域开发学科
应用生物科学科
短大