休斯顿地区拥有众多高等教育机构，以下是部分知名大学列表：
莱斯大学 （Rice University）
私立大学，位于休斯顿市郊，以工程、管理、科学、艺术、人类学等专业知名。
休斯顿大学 （University of Houston）
公立大学，位于市中心，学科涵盖自然科学、财经、法律、工程学等领域。
德克萨斯南方大学 （Texas Southern University）
公立大学，位于市区，以药剂学为最优秀学科，是美国历史上最大最著名的一所少数民族州立研究型大学。
贝勒医学院 （Baylor College of Medicine）
私立医学院，以卓越的教育、研究和患者护理而闻名。
休斯顿浸会大学 （Houston Baptist University）
信仰和学术社区，自1960年成立以来已发展成为一所繁荣的学校。
休斯顿社区学院系统 （Houston Community College System）
德克萨斯州墨西哥湾沿岸最大的社区学院系统，由五所地区学院组成。
以上信息基于最近的数据更新，具体情况可能会有所变化。