首批101计划入选的高校共有33所，其中包括：
1. 清华大学
2. 北京大学
3. 北京航空航天大学
4. 北京邮电大学
5. 北京交通大学
6. 中国人民大学
7. 北京理工大学
8. 中国科学院大学
9. 天津大学
10. 上海交通大学
11. 复旦大学
12. 同济大学
13. 华东师范大学
14. 南开大学
15. 东北师范大学
16. 上海财经大学
17. 中国科学技术大学
18. 西南财经大学
19. 云南大学
20. 江西财经大学
21. 南方科技大学
22. 西安交通大学
23. 西北工业大学
24. 国防科技大学
25. 南京大学
26. 东南大学
27. 武汉大学
28. 华中科技大学
29. 中山大学
30. 华南理工大学
31. 哈尔滨工业大学
32. 四川大学
33. 中国农业大学
这些高校在各自的学科领域内具有很高的学术水平和研究实力，入选101计划是对其学科实力的一种肯定。