大学在税收方面存在一些问题，主要包括：
营业税问题
技术转让收入未申报缴纳营业税或未办理减免手续。
非学历教育收入未开具发票，未进行申报。
土地使用税问题
出租门面房取得租金收入后，只开具收据而不开发票，导致漏交土地使用税。
税收管理不规范
缺乏有效的纳税管理制度。
收入认定不准确，税务资料不完备。
纳税申报操作不规范，如填写错误的纳税申报表、漏报税款等。
税收管理信息化程度低
使用传统纸质报税方式，导致税收管理效率低下，容易出现漏报、错报等情况。
税收管理规章制度不完善
对于新兴的税收问题没有明确的管理办法，导致税收管理不规范和混乱。
税收管理缺乏专业人才
高校税收管理人才结构单一，缺乏全面的税收管理专业人才。
收费管理问题
收费多头管理和“双轨制”导致收费混乱，票据使用、收入核算不规范。
税收政策不一致
非税收入项目多、涉及范围广、缴费情况复杂，各地政策不一致，管理方式多样化。
针对上述问题，高校可以采取以下措施进行改进：
建立完善的纳税管理制度，规范税务管理行为。
提高税收管理的信息化程度，采用电子报税等方式。
完善税收管理的规章制度，明确新兴税收问题的管理办法。
培养和引进专业的税收管理人才。
统一管理收费，确保票据使用和收入核算的规范性。
协调各部门监督，统一规范非税收入管理