爱丁堡大学由三大学院组成，分别是艺术、人文与社会科学学院、医学与兽医学院、科学与工程学院。每个学院下设有多个系，以下是部分系的列表：
艺术、人文与社会科学学院
建筑系
建筑历史系
商业研究系
经济与社会历史系
经济系
地理系
护理系
政治学系
心理学系
社会政策系
社会人类学系
社会学系
非洲研究中心
加拿大研究中心
科学与工程学院
数学系
物理系
化学系
生物科学系
地球科学系
信息学系
工程学系
医学与兽医学院
医学院
兽医学院
请注意，以上信息可能不全面，且随时间可能会有变动。建议直接访问爱丁堡大学的官方网站或联系学校获取最新的院系和系所信息