边疆地区的冷门大学包括：
黑龙江工业学院：
位于中俄边境城市鸡西，以工学为主，特色专业有测绘工程等。
喀什大学：
位于最西部，前身喀什师范学院，是中国中西部高校基础能力建设高校之一。
海南热带海洋学院：
位于海南省，由多方共建，特色专业有海洋科学等。
黑河学院：
位于中俄边境线上中国境内，是中俄合作应用型人才培养实验区。
伊犁师范大学：
位于新疆伊宁市，是一所省部共建高校，代表专业优势明显。
兰州大学：
地处偏远的西部甘肃，是985、211双一流大学，但因地理位置较偏而冷门。
宁夏大学：
位于宁夏银川市，由于地理位置和少数民族政策，生源和就业机会有限。
海南大学：
位于海南省海口市，地处热带，物价较贵，企业较少。
青海大学：
位于青海西宁市，就业率和读研率相对较低。
石河子大学：
位于新疆石河子市，边疆少数民族政策，内地认可度较低。
西藏大学：
位于西藏拉萨市，由于地理位置和高原反应问题，普通学生难以适应。
广西大学：
虽然历史悠久，但现在的广西大学已没有当年的精华。
延边大学：
位于吉林省延边朝鲜族自治州延吉市，地理位置偏僻。
东北林业大学：
位于黑龙江省哈尔滨市，以林科为优势。
四川农业大学：
位于四川省，以生物科技为特色，农业科技为优势。
这些大学通常因为地理位置偏远、气候条件艰苦、经济发展水平较低等因素，导致报考人数较少，成为所谓的“冷门”大学。不过，每所大学都有其特色和优势专业，对于有意向在这些地区学习或工作的学生来说，仍然值得考虑。