巴塞尔大学提供广泛的本科和研究生专业，以下是一些主要的专业设置：
本科专业
神学
法学
医学
护理学
体育学
东欧研究
考古学
外国语言与文学（英语、法国语言及文学、西班牙语言及文学、北欧语言学等）
历史学
艺术史
伊斯兰学
哲学
音乐
东欧文化
化学
生物学
社会学
计算机科学
物理学
数学
心理学
研究生专业
欧洲研究
人文学
护理学
法学
牙科学
非洲研究
体育
语言及传播学
历史学
犹太研究/闪语
伊斯兰学
其他专业
农业经济学
环境学
视频科学
营养学
饮食学
生物资源工程
农产品
环境工程
非洲研究
人类研究
艺术历史
加拿大研究
计算机科学
东亚研究
经济学与会计
英语
法语
德语
西班牙语
国际发展研究
意大利语
语言学
数学
中东研究
音乐
政治学
哲学
心理学
社会学
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