截至2024年，扬州大学和南通大学的排名如下：
扬州大学：
位列第81位。
南通大学：
排在第161位。
从排名来看，扬州大学一直位列全国百强，而南通大学则位于200位左右。从学科评估来说，扬州大学有A-、B+和B多个学科，而南通大学最好的则是基础医学B-。从每年的录取分数线来看，扬州大学要高出南通大学十多分，因此扬州大学在整体实力上比南通大学更强一些。
建议：
扬州大学在整体排名和学科评估上表现更优，是江苏省属重点综合性大学，江苏高水平大学建设A类高校。
南通大学虽然排名相对较低，但其在临床医学、语言文学、工程学等学科在地方及周边地区享有一定的知名度，且是江苏省人民政府和国家交通运输部共建的综合性大学，江苏省十五所重点建设大学成员。
根据具体需求和目标，可以选择适合自己的学校进行报考或进一步了解。