南通大学的好专业包括以下几个方面：
医学类专业
临床医学：这是南通大学的王牌专业，也是国家特色专业建设点和国家一流本科专业。该专业拥有硕士和博士学位授权点，并设有博士后流动站，是南通大学唯一集王牌热门与本硕博连读的专业。
预防医学：同样是国家级特色专业建设点和国家一流本科专业。
基础医学、 生物医学工程：这些专业在医学领域也有很好的声誉和影响力。
工科类专业
电气工程及其自动化：这是国家特色专业建设点和国家一流本科专业，与国网等知名企业有紧密的合作关系。
机械工程及其自动化、 自动化、 计算机科学与技术：这些专业也是国家级一流本科专业建设点，就业前景广阔。
电子信息工程：该专业在江苏省内及行业内有较高的认可度。
师范类专业
汉语言文学、 小学教育：这些专业是国家级一流本科专业建设点，培养了大量优秀的教师和教育工作者。
其他优势专业
英语：国家级特色专业建设点，培养具有扎实英语语言基础和教育能力的人才。
生物科学、 材料科学与工程、 环境科学与工程：这些专业在各自领域内也有很好的发展。
综上所述，南通大学的好专业主要集中在医学、工科和师范类专业中，其中临床医学、电气工程及其自动化、汉语言文学、小学教育等专业是王牌专业，具有较高的声誉和就业竞争力。建议学生在选择专业时，可以根据自己的兴趣和职业规划，优先考虑这些专业。