关于公务员考试违约金的问题，以下是一些关键点：
三方协议与劳动合同的区别
三方协议是毕业生、用人单位和学校三方在学生毕业后工作中签订的一份用人协议，而劳动合同是用人单位与劳动者之间签订的关于劳动关系的协议。三方协议不是劳动合同，因此在违约金的约定和适用上，应当适用《合同法》而非《劳动合同法》。
违约金的上限
法律上规定了违约金的上限不得超过实际损失的30%。如果约定的违约金数额低于实际损失，当事人可以请求人民法院或仲裁机构予以适当增加，以使违约金与实际损失大体相当。
是否需要支付违约金
是否需要支付违约金取决于三方协议中的具体条款。如果协议中明确规定了考上公务员需要支付违约金，则需要按照协议执行。
如果协议中没有相关规定，一般情况下不需要支付违约金。
特殊情况下的违约金
如果用人单位为劳动者提供了专项培训并约定了服务期，劳动者违反服务期约定的，需要支付违约金。违约金的计算方法是培训费除以约定的服务年限，乘以违约年限。
劳动者违反竞业限制约定的，也需要按照约定向用人单位支付违约金。
法律依据
根据《劳动合同法》第二十二条和第二十三条，用人单位为劳动者提供专项培训费用并约定服务期的，劳动者违反服务期约定的，应当支付违约金。
除上述情形外，用人单位不得与劳动者约定由劳动者承担违约金。
建议
仔细阅读三方协议：在签订三方协议时，务必仔细阅读协议条款，了解其中关于违约金的相关约定。
咨询专业人士：如果对协议内容有疑问，建议咨询专业的法律人士，以确保自己的权益不受损害。
保留证据：在签订任何协议时，建议保留好相关证据，以便在必要时维护自己的合法权益。
希望以上信息对你有所帮助。