扬州大学出版的杂志主要包括以下几种：
《扬州大学学报（人文社会科学版）》
综合性人文社会科学学术刊物。
特色栏目包括“中国特色社会主义理论研究”、“苏中地区经济社会发展研究”等。
被多个数据库收录，如RCCSE、AMI扩展、维普、知网及NCPSSD等。
《扬州大学学报（高教研究版）》
综合性高等教育研究刊物。
发表高等教育改革和发展的理论性研究论文及高校教育教学改革实践经验。
被多个数据库收录，知网复合影响因子0.734，综合影响因子0.384。
《扬州大学学报（自然科学版）》
自然科学综合性学术刊物。
主要刊登数理科学、化学、工业技术、环境科学等领域的学术论文。
被多个国内外著名检索期刊收录。
《扬州大学学报（农业与生命科学版）》
综合性农业与生命科学学术期刊。
主要刊登农业科学、动物科学、生物技术等领域的学术论文。
多次获得教育部“全国高校优秀科技期刊一等奖”等荣誉。
这些杂志均具有较高的学术价值和影响力，被多个数据库收录，并在学术界享有一定的声誉。